Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlx1P43345 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlx1P43345 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlx1P43345 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlx1P43345 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tlx1P43345 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tlx1P43345 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tlx1P43345 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlx1P43345 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tlx1P43345 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tlx1P43345 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlx1P43345 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlx1P43345 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlx1P43345 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlx1P43345 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlx1P43345 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlx1P43345 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlx1P43345 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tlx1P43345 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlx1P43345 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlx1P43345 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlx1P43345 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlx1P43345 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlx1P43345 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlx1P43345 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlx1P43345 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tlx1P43345 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlx1P43345 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlx1P43345 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tlx1P43345 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tlx1P43345 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tlx1P43345 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tlx1P43345 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tlx1P43345 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tlx1P43345 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tlx1P43345 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tlx1P43345 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tlx1P43345 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tlx1P43345 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tlx1P43345 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tlx1P43345 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tlx1P43345 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tlx1P43345 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tlx1P43345 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tlx1P43345 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tlx1P43345 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tlx1P43345 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tlx1P43345 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tlx1P43345 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tlx1P43345 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tlx1P43345 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tlx1P43345 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tlx1P43345 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tlx1P43345 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tlx1P43345 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tlx1P43345 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tlx1P43345 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tlx1P43345 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tlx1P43345 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tlx1P43345 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tlx1P43345 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tlx1P43345 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tlx1P43345 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tlx1P43345 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tlx1P43345 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tlx1P43345 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tlx1P43345 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tlx1P43345 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tlx1P43345 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tlx1P43345 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tlx1P43345 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tlx1P43345 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tlx1P43345 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tlx1P43345 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tlx1P43345 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tlx1P43345 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tlx1P43345 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tlx1P43345 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tlx1P43345 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tlx1P43345 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tlx1P43345 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tlx1P43345 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tlx1P43345 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tlx1P43345 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tlx1P43345 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tlx1P43345 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tlx1P43345 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tlx1P43345 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tlx1P43345 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tlx1P43345 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tlx1P43345 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tlx1P43345 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tlx1P43345 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tlx1P43345 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tlx1P43345 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tlx1P43345 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tlx1P43345 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tlx1P43345 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tlx1P43345 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tlx1P43345 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms