Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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