Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd9P40240 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd9P40240 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd9P40240 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd9P40240 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd9P40240 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd9P40240 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd9P40240 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd9P40240 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd9P40240 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd9P40240 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd9P40240 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd9P40240 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd9P40240 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms