Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HmgclP38060 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HmgclP38060 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HmgclP38060 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HmgclP38060 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HmgclP38060 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HmgclP38060 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HmgclP38060 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HmgclP38060 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HmgclP38060 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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