Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms