Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pola2P33611 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pola2P33611 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pola2P33611 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pola2P33611 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pola2P33611 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pola2P33611 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pola2P33611 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pola2P33611 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms