Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms