Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc10P31257 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms