Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms