Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrgP28705 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrgP28705 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrgP28705 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrgP28705 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrgP28705 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrgP28705 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrgP28705 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrgP28705 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrgP28705 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms