Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms