Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChgaP26339 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChgaP26339 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ChgaP26339 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChgaP26339 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChgaP26339 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChgaP26339 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChgaP26339 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms