Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms