Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PparaP23204 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PparaP23204 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PparaP23204 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PparaP23204 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PparaP23204 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PparaP23204 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PparaP23204 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PparaP23204 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PparaP23204 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PparaP23204 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PparaP23204 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PparaP23204 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PparaP23204 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PparaP23204 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PparaP23204 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PparaP23204 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PparaP23204 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PparaP23204 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PparaP23204 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PparaP23204 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PparaP23204 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PparaP23204 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PparaP23204 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PparaP23204 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PparaP23204 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PparaP23204 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PparaP23204 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PparaP23204 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PparaP23204 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PparaP23204 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PparaP23204 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PparaP23204 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PparaP23204 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PparaP23204 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PparaP23204 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PparaP23204 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PparaP23204 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PparaP23204 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PparaP23204 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PparaP23204 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PparaP23204 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PparaP23204 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PparaP23204 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PparaP23204 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PparaP23204 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PparaP23204 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PparaP23204 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PparaP23204 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PparaP23204 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PparaP23204 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PparaP23204 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PparaP23204 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PparaP23204 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PparaP23204 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PparaP23204 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PparaP23204 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PparaP23204 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PparaP23204 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PparaP23204 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PparaP23204 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PparaP23204 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PparaP23204 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PparaP23204 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PparaP23204 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PparaP23204 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PparaP23204 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PparaP23204 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PparaP23204 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PparaP23204 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PparaP23204 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PparaP23204 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PparaP23204 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PparaP23204 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PparaP23204 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PparaP23204 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PparaP23204 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PparaP23204 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PparaP23204 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PparaP23204 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PparaP23204 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PparaP23204 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PparaP23204 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PparaP23204 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PparaP23204 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PparaP23204 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PparaP23204 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PparaP23204 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PparaP23204 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PparaP23204 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PparaP23204 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PparaP23204 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PparaP23204 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PparaP23204 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PparaP23204 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PparaP23204 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PparaP23204 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PparaP23204 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PparaP23204 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PparaP23204 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms