Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms