Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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