Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp53P15975 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp53P15975 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp53P15975 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp53P15975 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp53P15975 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp53P15975 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp53P15975 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp53P15975 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp53P15975 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp53P15975 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp53P15975 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp53P15975 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp53P15975 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp53P15975 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp53P15975 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp53P15975 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp53P15975 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp53P15975 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp53P15975 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp53P15975 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp53P15975 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp53P15975 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp53P15975 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp53P15975 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp53P15975 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms