Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms