Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TtrP07309 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TtrP07309 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TtrP07309 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TtrP07309 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TtrP07309 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TtrP07309 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TtrP07309 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TtrP07309 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TtrP07309 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TtrP07309 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TtrP07309 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TtrP07309 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TtrP07309 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TtrP07309 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TtrP07309 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TtrP07309 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TtrP07309 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TtrP07309 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TtrP07309 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TtrP07309 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TtrP07309 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TtrP07309 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TtrP07309 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TtrP07309 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TtrP07309 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TtrP07309 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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TtrP07309 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TtrP07309 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TtrP07309 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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TtrP07309 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TtrP07309 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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TtrP07309 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TtrP07309 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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TtrP07309 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TtrP07309 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TtrP07309 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TtrP07309 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TtrP07309 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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TtrP07309 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TtrP07309 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TtrP07309 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TtrP07309 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TtrP07309 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TtrP07309 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TtrP07309 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TtrP07309 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TtrP07309 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TtrP07309 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TtrP07309 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TtrP07309 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TtrP07309 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TtrP07309 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TtrP07309 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TtrP07309 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TtrP07309 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TtrP07309 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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