Protein–RNA interactions for Protein: P01736

T-cell receptor beta chain V region PHDS203 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01736 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01736 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
P01736 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01736 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01736 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01736 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01736 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01736 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01736 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01736 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01736 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01736 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01736 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01736 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01736 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01736 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01736 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01736 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01736 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01736 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P01736 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01736 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01736 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01736 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01736 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01736 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01736 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01736 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01736 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01736 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01736 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01736 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01736 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01736 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01736 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01736 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01736 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01736 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01736 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01736 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01736 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01736 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01736 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01736 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P01736 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01736 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01736 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01736 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01736 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01736 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01736 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01736 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01736 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01736 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms