Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gnpda1O88958 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gnpda1O88958 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gnpda1O88958 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gnpda1O88958 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gnpda1O88958 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gnpda1O88958 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gnpda1O88958 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gnpda1O88958 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gnpda1O88958 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gnpda1O88958 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms