Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms