Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms