Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CrxO54751 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CrxO54751 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CrxO54751 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CrxO54751 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
CrxO54751 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CrxO54751 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CrxO54751 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CrxO54751 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CrxO54751 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CrxO54751 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CrxO54751 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CrxO54751 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CrxO54751 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CrxO54751 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CrxO54751 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CrxO54751 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CrxO54751 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CrxO54751 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CrxO54751 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CrxO54751 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CrxO54751 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CrxO54751 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CrxO54751 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CrxO54751 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CrxO54751 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CrxO54751 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
CrxO54751 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CrxO54751 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CrxO54751 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CrxO54751 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CrxO54751 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CrxO54751 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CrxO54751 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CrxO54751 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CrxO54751 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CrxO54751 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CrxO54751 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CrxO54751 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
CrxO54751 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CrxO54751 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CrxO54751 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CrxO54751 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CrxO54751 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CrxO54751 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CrxO54751 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CrxO54751 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CrxO54751 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CrxO54751 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms