Protein–RNA interactions for Protein: O35973

Per1, Period circadian protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Per1O35973 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Per1O35973 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Per1O35973 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Per1O35973 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Per1O35973 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Per1O35973 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Per1O35973 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Per1O35973 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Per1O35973 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Per1O35973 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Per1O35973 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Per1O35973 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Per1O35973 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Per1O35973 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Per1O35973 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Per1O35973 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Per1O35973 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Per1O35973 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Per1O35973 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Per1O35973 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Per1O35973 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Per1O35973 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Per1O35973 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Per1O35973 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Per1O35973 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Per1O35973 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Per1O35973 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Per1O35973 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Per1O35973 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Per1O35973 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Per1O35973 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Per1O35973 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Per1O35973 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Per1O35973 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Per1O35973 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Per1O35973 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Per1O35973 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Per1O35973 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per1O35973 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per1O35973 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per1O35973 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Per1O35973 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per1O35973 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per1O35973 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per1O35973 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per1O35973 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per1O35973 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per1O35973 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Per1O35973 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Per1O35973 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per1O35973 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per1O35973 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per1O35973 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Per1O35973 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Per1O35973 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per1O35973 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per1O35973 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per1O35973 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per1O35973 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per1O35973 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per1O35973 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per1O35973 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per1O35973 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per1O35973 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Per1O35973 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Per1O35973 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Per1O35973 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Per1O35973 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Per1O35973 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per1O35973 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per1O35973 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per1O35973 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per1O35973 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per1O35973 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per1O35973 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per1O35973 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per1O35973 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per1O35973 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per1O35973 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per1O35973 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per1O35973 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per1O35973 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per1O35973 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per1O35973 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per1O35973 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per1O35973 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per1O35973 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per1O35973 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per1O35973 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per1O35973 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per1O35973 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per1O35973 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Per1O35973 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Per1O35973 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Per1O35973 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Per1O35973 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Per1O35973 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Per1O35973 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Per1O35973 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Per1O35973 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms