Protein–RNA interactions for Protein: O35595

Ptch2, Protein patched homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptch2O35595 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptch2O35595 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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