Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Prrt1O35449 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Prrt1O35449 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Prrt1O35449 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt1O35449 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt1O35449 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt1O35449 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt1O35449 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt1O35449 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt1O35449 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt1O35449 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt1O35449 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt1O35449 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt1O35449 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt1O35449 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt1O35449 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt1O35449 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt1O35449 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt1O35449 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt1O35449 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt1O35449 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt1O35449 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt1O35449 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt1O35449 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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