Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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H2-ObO35424 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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H2-ObO35424 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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H2-ObO35424 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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