Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tnfrsf11aO35305 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tnfrsf11aO35305 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tnfrsf11aO35305 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tnfrsf11aO35305 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tnfrsf11aO35305 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tnfrsf11aO35305 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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