Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms