Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
U90926O08546 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
U90926O08546 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
U90926O08546 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
U90926O08546 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
U90926O08546 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
U90926O08546 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
U90926O08546 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
U90926O08546 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
U90926O08546 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
U90926O08546 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
U90926O08546 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
U90926O08546 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
U90926O08546 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
U90926O08546 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
U90926O08546 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
U90926O08546 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
U90926O08546 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
U90926O08546 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
U90926O08546 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
U90926O08546 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
U90926O08546 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
U90926O08546 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
U90926O08546 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
U90926O08546 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
U90926O08546 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
U90926O08546 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
U90926O08546 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
U90926O08546 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
U90926O08546 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
U90926O08546 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
U90926O08546 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
U90926O08546 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
U90926O08546 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
U90926O08546 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
U90926O08546 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
U90926O08546 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
U90926O08546 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
U90926O08546 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
U90926O08546 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
U90926O08546 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
U90926O08546 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
U90926O08546 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
U90926O08546 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
U90926O08546 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
U90926O08546 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms