Protein–RNA interactions for Protein: J3QK59

Gm6176, Predicted gene 6176, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6176J3QK59 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6176J3QK59 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm6176J3QK59 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm6176J3QK59 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm6176J3QK59 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm6176J3QK59 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm6176J3QK59 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm6176J3QK59 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm6176J3QK59 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm6176J3QK59 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm6176J3QK59 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm6176J3QK59 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm6176J3QK59 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm6176J3QK59 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm6176J3QK59 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm6176J3QK59 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm6176J3QK59 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6176J3QK59 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6176J3QK59 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6176J3QK59 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6176J3QK59 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6176J3QK59 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6176J3QK59 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6176J3QK59 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6176J3QK59 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6176J3QK59 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6176J3QK59 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6176J3QK59 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6176J3QK59 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6176J3QK59 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6176J3QK59 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6176J3QK59 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms