Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21411J3KMS0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms