Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms