Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms