Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms