Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms