Protein–RNA interactions for Protein: F8VPP8

Zc3h7b, Zinc finger CCCH type-containing 7B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h7bF8VPP8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zc3h7bF8VPP8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zc3h7bF8VPP8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zc3h7bF8VPP8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zc3h7bF8VPP8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms