Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5160F8VPN3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms