Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm28048F7BCN0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm28048F7BCN0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm28048F7BCN0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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