Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Trim2-205ENSMUST00000107693 5755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Celf1-203ENSMUST00000068747 7614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Prdm16-206ENSMUST00000105638 8601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Sp3-201ENSMUST00000066003 3808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 AC154176.2-201ENSMUST00000225376 6429 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Gm38359-201ENSMUST00000191884 2225 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Tln2-207ENSMUST00000215784 8330 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms