Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa35E9QLQ1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa35E9QLQ1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms