Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms