Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms