Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Srp54bE9PXC0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Srp54bE9PXC0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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