Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3002E9PW72 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms