Protein–RNA interactions for Protein: E9PUT9

Gm3252, Predicted gene 3252, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3252E9PUT9 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3252E9PUT9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3252E9PUT9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3252E9PUT9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3252E9PUT9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3252E9PUT9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3252E9PUT9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3252E9PUT9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3252E9PUT9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3252E9PUT9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3252E9PUT9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3252E9PUT9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3252E9PUT9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3252E9PUT9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms