Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms