Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms