Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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